本土店是指注册地和经营主体均在中国大陆地区的店铺，主要面向国内市场。本土店可以使用人民币结算，可以享受国内的物流服务和税收政策。

跨境店是指注册地和经营主体均在中国大陆以外的店铺，主要面向海外市场。跨境店需要使用外汇结算，可以享受跨境电商的税收政策和物流服务。

本土店和跨境店在注册和经营上存在一些区别，包括注册资质、报关流程、税务管理等。在经营模式上，本土店主要通过供应链和品牌运营等方式获得竞争优势，而跨境店则需要考虑海外市场的文化差异和法律法规等因素，以及如何进行海外品牌推广和客户服务。